Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MarcoQ60754 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MarcoQ60754 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MarcoQ60754 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MarcoQ60754 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MarcoQ60754 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MarcoQ60754 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MarcoQ60754 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms