Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcf4Q60722 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcf4Q60722 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcf4Q60722 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcf4Q60722 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcf4Q60722 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms