Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,85■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,85■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22,85■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22,83■■□□□ 1,25
PtprnQ60673 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22,82■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22,81■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,79■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22,78■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22,77■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22,77■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22,77■■□□□ 1,24
PtprnQ60673 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,74■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,73■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22,71■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
PtprnQ60673 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,68■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22,68■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22,68■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22,65■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,22
PtprnQ60673 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22,64■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22,64■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,62■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22,6■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
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