Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprnQ60673 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprnQ60673 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprnQ60673 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprnQ60673 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprnQ60673 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms