Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CttnQ60598 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CttnQ60598 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CttnQ60598 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CttnQ60598 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CttnQ60598 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CttnQ60598 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CttnQ60598 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CttnQ60598 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CttnQ60598 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CttnQ60598 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CttnQ60598 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CttnQ60598 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CttnQ60598 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CttnQ60598 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CttnQ60598 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms