Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atp13a3Q5XF89 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp13a3Q5XF89 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp13a3Q5XF89 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp13a3Q5XF89 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp13a3Q5XF89 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp13a3Q5XF89 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp13a3Q5XF89 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp13a3Q5XF89 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp13a3Q5XF89 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp13a3Q5XF89 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp13a3Q5XF89 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp13a3Q5XF89 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms