Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc5a6Q5U4D8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc5a6Q5U4D8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc5a6Q5U4D8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms