Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Med13Q5SWW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med13Q5SWW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Med13Q5SWW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Med13Q5SWW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med13Q5SWW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms