Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r196Q5SVD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vmn1r196Q5SVD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r196Q5SVD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r196Q5SVD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.4 ms