Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trav8d-2Q5R1B6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trav8d-2Q5R1B6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trav8d-2Q5R1B6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trav8d-2Q5R1B6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trav8d-2Q5R1B6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trav8d-2Q5R1B6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trav8d-2Q5R1B6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trav8d-2Q5R1B6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms