Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim58Q5NCC9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trim58Q5NCC9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim58Q5NCC9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim58Q5NCC9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim58Q5NCC9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms