Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrc3Q5DU56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrc3Q5DU56 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nlrc3Q5DU56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms