Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam208bQ5DTT3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam208bQ5DTT3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam208bQ5DTT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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