Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrig2Q52KR2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig2Q52KR2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrig2Q52KR2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrig2Q52KR2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrig2Q52KR2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms