Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Phactr4Q501J7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phactr4Q501J7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Phactr4Q501J7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phactr4Q501J7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phactr4Q501J7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms