Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD9

Nxf3, Nuclear RNA export factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf3Q4ZGD9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxf3Q4ZGD9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxf3Q4ZGD9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nxf3Q4ZGD9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxf3Q4ZGD9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms