Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Pds5bQ4VA53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Pds5bQ4VA53 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Pds5bQ4VA53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Pds5bQ4VA53 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Pds5bQ4VA53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Pds5bQ4VA53 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Pds5bQ4VA53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Pds5bQ4VA53 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Pds5bQ4VA53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Pds5bQ4VA53 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
Pds5bQ4VA53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Pds5bQ4VA53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Pds5bQ4VA53 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC42■■■■■ 4.31
Pds5bQ4VA53 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Pds5bQ4VA53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
Pds5bQ4VA53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Pds5bQ4VA53 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Pds5bQ4VA53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Pds5bQ4VA53 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Pds5bQ4VA53 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Pds5bQ4VA53 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Pds5bQ4VA53 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Pds5bQ4VA53 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Pds5bQ4VA53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms