Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a5Q4LDG0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc27a5Q4LDG0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc27a5Q4LDG0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc27a5Q4LDG0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms