Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2al1nQ497L1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1nQ497L1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1nQ497L1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al1nQ497L1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al1nQ497L1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms