Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Carmil2Q3V3V9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Carmil2Q3V3V9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Carmil2Q3V3V9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Carmil2Q3V3V9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil2Q3V3V9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil2Q3V3V9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil2Q3V3V9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms