Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pydc3Q3V3Q4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pydc3Q3V3Q4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pydc3Q3V3Q4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pydc3Q3V3Q4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pydc3Q3V3Q4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms