Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc185Q3V118 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc185Q3V118 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc185Q3V118 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc185Q3V118 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc185Q3V118 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc185Q3V118 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc185Q3V118 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc185Q3V118 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc185Q3V118 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc185Q3V118 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms