Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmprss12Q3V0Q7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmprss12Q3V0Q7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmprss12Q3V0Q7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmprss12Q3V0Q7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmprss12Q3V0Q7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms