Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc9Q3V038 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc9Q3V038 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc9Q3V038 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttc9Q3V038 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc9Q3V038 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc9Q3V038 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.5 ms