Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SfswapQ3USH5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SfswapQ3USH5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SfswapQ3USH5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SfswapQ3USH5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SfswapQ3USH5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SfswapQ3USH5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms