Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E130208F15RikQ3UPV3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms