Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl2Q3UMU9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdgfl2Q3UMU9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdgfl2Q3UMU9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdgfl2Q3UMU9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms