Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem241Q3UME2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem241Q3UME2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem241Q3UME2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem241Q3UME2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms