Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cog7Q3UM29 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cog7Q3UM29 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cog7Q3UM29 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cog7Q3UM29 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms