Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ell2Q3UKU1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ell2Q3UKU1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ell2Q3UKU1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ell2Q3UKU1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ell2Q3UKU1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms