Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf10Q3UIW5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf10Q3UIW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf10Q3UIW5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf10Q3UIW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf10Q3UIW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf10Q3UIW5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf10Q3UIW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf10Q3UIW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms