Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Carmil3Q3UFQ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Carmil3Q3UFQ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Carmil3Q3UFQ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Carmil3Q3UFQ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Carmil3Q3UFQ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Carmil3Q3UFQ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Carmil3Q3UFQ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 982.4 ms