Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc10a4Q3UEZ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Slc10a4Q3UEZ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slc10a4Q3UEZ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc10a4Q3UEZ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc10a4Q3UEZ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms