Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trafd1Q3UDK1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trafd1Q3UDK1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trafd1Q3UDK1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Trafd1Q3UDK1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trafd1Q3UDK1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trafd1Q3UDK1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms