Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttll12Q3UDE2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttll12Q3UDE2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll12Q3UDE2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttll12Q3UDE2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttll12Q3UDE2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttll12Q3UDE2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttll12Q3UDE2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttll12Q3UDE2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms