Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms