Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pid1Q3UBG2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pid1Q3UBG2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pid1Q3UBG2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pid1Q3UBG2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pid1Q3UBG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms