Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops9Q3U898 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cops9Q3U898 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops9Q3U898 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms