Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rnf180Q3U827 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rnf180Q3U827 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Rnf180Q3U827 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Rnf180Q3U827 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Rnf180Q3U827 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Rnf180Q3U827 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Rnf180Q3U827 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Rnf180Q3U827 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Rnf180Q3U827 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Rnf180Q3U827 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rnf180Q3U827 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rnf180Q3U827 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rnf180Q3U827 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Rnf180Q3U827 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Rnf180Q3U827 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63,2 ms