Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc174Q3U155 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc174Q3U155 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc174Q3U155 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc174Q3U155 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc174Q3U155 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms