Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a5Q3TYU2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp13a5Q3TYU2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp13a5Q3TYU2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a5Q3TYU2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms