Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccndbp1Q3TVC7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccndbp1Q3TVC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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