Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700066B19RikQ3TS39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
1700066B19RikQ3TS39 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1700066B19RikQ3TS39 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700066B19RikQ3TS39 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1700066B19RikQ3TS39 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms