Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Calr4Q3TQS0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Calr4Q3TQS0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Calr4Q3TQS0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Calr4Q3TQS0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms