Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc13Q3TIR1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc13Q3TIR1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trappc13Q3TIR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc13Q3TIR1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc13Q3TIR1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms