Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc69Q3TCJ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc69Q3TCJ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc69Q3TCJ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc69Q3TCJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc69Q3TCJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms