Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap5b1Q3TAP4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap5b1Q3TAP4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap5b1Q3TAP4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap5b1Q3TAP4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap5b1Q3TAP4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap5b1Q3TAP4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms