Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr27Q3SYJ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prr27Q3SYJ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prr27Q3SYJ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prr27Q3SYJ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prr27Q3SYJ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms