Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
V1rd19Q3KNP5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
V1rd19Q3KNP5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
V1rd19Q3KNP5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
V1rd19Q3KNP5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms