Protein–RNA interactions for Protein: Q0WXH6

Gm7030, MHC class Ib T9, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7030Q0WXH6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7030Q0WXH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7030Q0WXH6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm7030Q0WXH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7030Q0WXH6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7030Q0WXH6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7030Q0WXH6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm7030Q0WXH6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm7030Q0WXH6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm7030Q0WXH6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm7030Q0WXH6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm7030Q0WXH6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms