Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
VgfQ0VGU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VgfQ0VGU4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VgfQ0VGU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VgfQ0VGU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms