Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrioQ0KL02 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TrioQ0KL02 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TrioQ0KL02 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TrioQ0KL02 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TrioQ0KL02 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms